单细胞 RNA 测序

来源明确报告

  • P005 使用 10X Genomics 3’ scRNA-seq 分析 18 份 HR+/HER2− 转移性乳腺癌样本,区分肿瘤与免疫细胞状态、进展时间和细胞通讯,并将基因特征迁移至两个 bulk RNA 队列验证。
  • OA005 把单细胞 RNA 测序概括为解析肿瘤亚克隆结构和稀有耐药细胞群的工具,但没有提供特定队列、性能或临床效用数据。

Wiki 跨来源综合

单细胞 RNA 测序能把 bulk 平均表达拆分为细胞类型和状态,但“细胞簇”“轨迹”“通讯”和“亚克隆”往往依赖不同算法与额外证据。P005 展示了从单细胞发现到 bulk 验证的工作流,也显示样本量、取样部位、FFPE 插补和基因集合不完整会限制迁移;OA005 只提供更广的异质性监测定位。

证据边界

  • 转录状态不等于蛋白功能、谱系关系或因果机制;配体–受体分析通常是表达与知识库推断。
  • 稀有群体的发现受组织消化、细胞捕获、质控、批次校正和聚类参数影响。
  • 小样本单细胞发现需要独立队列、正交技术或功能扰动验证;不能由分群结果直接建立患者选药标准。
  • OA005 为三级来源,不核验单细胞技术的具体临床性能。